在伟大的希腊神话时代，宙斯与众兄弟姐妹联手打胜了奠定众神地位的“提坦之战”。三兄弟抓阄决定各自的领地，结果宙斯得到大地与天空，哈迪斯获得地狱，而手持三叉戟的波塞冬，则获得了广袤的海洋，成为伟大的海神。他的采邑被封在奥林匹亚圣山以西极远的大洋中，那是一座极其美丽丰饶的巨岛。
岛上原本生活着原始部族伊夫纳人，其族长之幼女克莱托父母自幼双亡，继任为岛屿女酋长。她的美丽让波塞冬悄然心动。风流成性的波塞冬用他那巨大的三叉戟将巨岛分割开，用几脉山水环环孤立了克莱托独居的宫舍……
于是，克莱托成了波塞冬的众多情人中的一位。不久便为他生下了五对双胞胎儿子。其中长子后来成了著名的擎天巨人，名叫“亚特拉斯”。
数年后，波塞冬非常想念深海的宫殿，于是将巨岛的疆土刻在铜板上，切成十份，分授十个儿子，册立长子亚特拉斯为国王，统领诸弟。为防止诸子日后争斗，海神特地取下三叉戟上的一截铜柄，深深地植入土中，亲手刻上禁止争斗、欺骗、纵欲的诫律全文，命诸子将各自的鲜血涂抹在铜柱上，当场立下永不违背的誓言。这尊铜柱后来被称为“神律铜柱”。
安顿好一切，波塞冬手持三叉戟，跃上金鬃骏马拉的战车，在无数海洋仙女和海豚的簇拥下，驾起滔天巨浪，回转深海中的宫殿去了。
亚特拉斯王命工匠用岛屿上最珍贵的大理石将父亲的形象刻成巨像，安放在神律铜柱之前，并在原地加盖起规模巨大的波塞冬神殿。以波塞冬神殿为圆心，亚特拉斯王命人在四周开掘三道环形运河，以桥梁交通内外。三道环形运河之间，则加盖房屋和官邸，遍种月桂树与橄榄树，供官员和贵族居住。国王本人的宫殿，则拱护波塞冬神殿四周，以便日夜聆听父亲的神谕。顺理成章地，新建的巨城成了国王的首都，命名为“波塞冬尼亚”，意即“波塞冬的城市”。
然而海神再没有回到这座以他命名的城市。克莱托终日以泪洗面，郁郁而终。据说她浅褐色的眼睛里流出的泪珠，全部化作了山中琥珀——后来被其子孙视为珍宝，称之为“山铜”。亚特拉斯王在登基时宣布，这片海中乐土今后将有一个正式名称——“亚特兰蒂斯”，意为亚特拉斯王的土地。
亚特兰蒂斯王国北部的山岗上有个属于大地女神盖亚的黄金果园，园中盛产的金苹果象征着尊贵、美丽与权力，由亚特拉斯王亲自守护。
不久以后，亚特拉斯王因为与宙斯之子珀耳修斯发生争执，误中珀耳修斯的诡计，目视女妖美杜莎的头颅，巨大的身躯瞬时石化，变作亚特兰蒂斯大陆东北部巍峨的亚特拉斯火山。于是，居住在奥林匹亚科斯山下的宙斯后人成了亚特兰蒂斯人不共戴天的死敌。
亚特拉斯王的长子阿瑞蒙泰斯在另外九名诸侯王兄弟的拥戴下继位。为了酬谢，阿瑞蒙泰斯授予九诸侯王在各自领土内独立的统治权，各领若干城邦，拱卫亚特拉斯家族所领的亚特兰蒂斯王国。每到五年一度的海神节，九位诸侯王必须拿着象征各自领土的铜板地图进入波塞冬尼亚祭祀海神，并向国王朝贡称臣。在阿瑞蒙泰斯王的统治下，亚特兰蒂斯大陆渐渐繁荣。后来阿瑞蒙泰斯王去世，与众多平民、贵族的坟墓同葬在亚特拉斯山下的“安息谷”。
亚特兰蒂斯人具备高尚的美德，他们崇敬海神、虔诚淳朴、诚信博爱、不渔不猎，以果菜为食。整个大陆上生物繁衍，品类繁盛，天人之间和谐无比。
然而到了第四代国王忒拜王统治时期，巨大的危机忽然从海上降临。尚武的古利克托尼亚人贪图亚特兰蒂斯的富庶，开始频频向大陆沿海发动攻击。素无戒备的亚特兰蒂斯人损失惨重，每年皆被掠走无数人畜。
不久，野心勃勃的古利克托尼亚国王克朗涅率领庞大的划桨舰队向亚特兰蒂斯发动总攻，无数城邦惨遭蹂躏。忒拜王亲率库克罗佩斯亲卫军抵抗，不幸在“罗提斯大泽战役”中全军覆没，国王战死。诸侯军队也相继被击败。克朗涅率古利克托尼亚战士攻陷波塞冬尼亚外城，将残余的亚特兰蒂斯人团团围在波塞冬神庙之中。
神律之柱前，诸侯王们为拥立谁为新任国王而争吵不休。以伊萨克国王老埃契乌斯为首的北部诸侯主张拥戴忒拜王胞弟卡耐翁；以莫贝林国王梅拉麦加斯为首的北部诸侯则主张遵守波塞冬神律遥立临阵逃亡的忒拜王之世子赫丘提亚斯。
危急时刻，卡耐翁挺身而出，以一席精彩的演说感动了在场所有人。在全体亚特兰蒂斯人虔诚的祈祷声中，神庙穹顶射入金光，神律之柱顶端出现了波塞冬昔日情人——正义女神阿斯特蕾亚的雕像。每个人的心中都响起了正义女神的声音——纯洁的亚特兰蒂斯人将获得正义女神永久的祝福。每个人身上都充满源源不绝的力量。
接受阿斯特蕾亚祝福的亚特兰蒂斯人在卡耐翁王的指挥下，重创古利克托尼亚人于歌斐亚海滩。克朗涅乘船远遁，不敢复来。护国战争结束。亚特兰蒂斯人也因之获得了永恒之力。
成为英雄的卡耐翁王秘密拜访了大预言家阿特凯西斯。后者向国王讲述了可怕的预言：“亚特兰蒂斯人彻底堕落，阿斯特蕾亚的黄金天秤不复平衡，波塞冬的王国将被无边的毁灭吞噬。”阿特凯西斯用秘宝预言之镜向国王展示了亚特兰蒂斯毁灭时的惨状，卡耐翁王束手无策，不久忧虑而死。
由于卡耐翁王没有子嗣，当初被剥夺继承人位置的赫丘提亚斯王子终于得以继位。由于嫉恨伊萨克国王老埃契乌斯拥戴卡耐翁王，竟派刺客将其刺杀于波塞冬神庙之内。事情败露，老埃契乌斯之子小埃契乌斯愤而发动叛乱。赫丘提亚斯王亲率库克罗佩斯亲卫军讨伐，却被伊萨克边境装备简陋的义从军奇袭击败。赫丘提亚斯王本人竟被生擒，受尽羞辱后被放回，被全国传为笑柄。从此亚特拉斯王族的权威一落千丈。
叛乱的小埃契乌斯最终被九诸侯之一的梅洛普国王墨涅拉俄斯击败。野心勃勃的墨涅拉俄斯乘机请求授予梅洛普王国自墨涅拉俄斯父子在领地安菲特里亚岛建造大型港口，建造贸易船，大力发展海运贸易，获得别国难以想象的暴利。同时，他又向国王进贡大量美色珍玩，使国王沉溺其中不可自拔，以便遥控王廷朝政。他国纷纷效仿，亚特兰蒂斯大陆的海面上很快就遍布商船。诸侯们都获得丰厚利润，实力渐张，相形而下，亚特兰蒂斯王廷显得贫困不堪。王室与贵族的实力差距渐渐被拉开，大陆的民风也变得逐渐功利奢靡，甚至为了制作船舶大量砍伐森林。
第七代亚特兰蒂斯国王厄玛托诺斯不愿坐视